一、特徵習性上的區別:
異蟲擁有將目標人物殺害,並擬態成被害人的習性。這個擬態能力,除了可以擬態成人類的外貌,還可以將記憶也完全複製出來。而原蟲沒有此特徵習性。
二、蛻皮功能上的區別:
原蟲蛻皮時間極慢,蛻皮後實力遠超異蟲之上,但在地球上生活的時間遠遠超出異蟲,多數的原蟲都不會被發現其真實身份是原蟲。
異蟲成長後能夠蛻進行蛻皮,進行高速化。
原蟲只能是幼蟲形態,經歷成長階段要幾十年。正是因為有這樣的原因,所以原蟲在異蟲之前已經到達了地球,他們開始與人類合作,創造出假面騎士系統。而這也是原蟲能夠使用昆蟲儀變身的原因,劇中原蟲立川大吾就曾經變身。